libuproc
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Enumerator
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u
Here is a list of all documented functions, variables, defines, enums, and typedefs with links to the documentation:
- u -
uproc_alphabet_amino_to_char() :
alphabet.h
uproc_alphabet_char_to_amino() :
alphabet.h
uproc_alphabet_create() :
alphabet.h
uproc_alphabet_destroy() :
alphabet.h
UPROC_ALPHABET_SIZE :
common.h
uproc_alphabet_str() :
alphabet.h
uproc_amino :
common.h
UPROC_AMINO_BITS :
common.h
UPROC_BINARY_CODON_COUNT :
codon.h
UPROC_BITMASK :
common.h
uproc_bst_create() :
bst.h
uproc_bst_destroy() :
bst.h
uproc_bst_get() :
bst.h
uproc_bst_insert() :
bst.h
uproc_bst_isempty() :
bst.h
UPROC_BST_KEY_EXISTS :
bst.h
UPROC_BST_KEY_NOT_FOUND :
bst.h
uproc_bst_keytype :
bst.h
uproc_bst_map() :
bst.h
uproc_bst_remove() :
bst.h
uproc_bst_size() :
bst.h
UPROC_BST_UINT :
bst.h
uproc_bst_update() :
bst.h
UPROC_BST_WORD :
bst.h
uproc_bstiter_create() :
bst.h
uproc_bstiter_destroy() :
bst.h
uproc_bstiter_next() :
bst.h
uproc_codon :
codon.h
uproc_codon_append() :
codon.h
UPROC_CODON_BITS :
codon.h
UPROC_CODON_COUNT :
codon.h
uproc_codon_get_nt() :
codon.h
uproc_codon_match() :
codon.h
UPROC_CODON_NTS :
codon.h
uproc_codon_prepend() :
codon.h
uproc_database_destroy() :
database.h
uproc_database_ecurve_forward() :
database.h
uproc_database_ecurve_reverse() :
database.h
uproc_database_idmap() :
database.h
uproc_database_load() :
database.h
uproc_database_protein_threshold() :
database.h
UPROC_DNACLASS_ALL :
dnaclass.h
uproc_dnaclass_classify() :
dnaclass.h
uproc_dnaclass_create() :
dnaclass.h
uproc_dnaclass_destroy() :
dnaclass.h
UPROC_DNACLASS_MAX :
dnaclass.h
uproc_dnaclass_mode :
dnaclass.h
uproc_dnaresult_copy() :
dnaclass.h
uproc_dnaresult_free() :
dnaclass.h
uproc_dnaresult_init() :
dnaclass.h
UPROC_DNARESULT_INITIALIZER :
dnaclass.h
uproc_ecurve_add_prefix() :
ecurve.h
uproc_ecurve_alphabet() :
ecurve.h
UPROC_ECURVE_BINARY :
ecurve.h
uproc_ecurve_create() :
ecurve.h
uproc_ecurve_destroy() :
ecurve.h
UPROC_ECURVE_EXACT :
ecurve.h
uproc_ecurve_finalize() :
ecurve.h
uproc_ecurve_format :
ecurve.h
UPROC_ECURVE_INEXACT :
ecurve.h
uproc_ecurve_load() :
ecurve.h
uproc_ecurve_loadp() :
ecurve.h
uproc_ecurve_loadpv() :
ecurve.h
uproc_ecurve_loads() :
ecurve.h
uproc_ecurve_loadv() :
ecurve.h
uproc_ecurve_lookup() :
ecurve.h
uproc_ecurve_mmap() :
ecurve.h
uproc_ecurve_mmap_store() :
ecurve.h
uproc_ecurve_mmap_storev() :
ecurve.h
uproc_ecurve_mmapv() :
ecurve.h
uproc_ecurve_munmap() :
ecurve.h
UPROC_ECURVE_OOB :
ecurve.h
UPROC_ECURVE_PLAIN :
ecurve.h
uproc_ecurve_store() :
ecurve.h
uproc_ecurve_storep() :
ecurve.h
uproc_ecurve_storeps() :
ecurve.h
uproc_ecurve_storepv() :
ecurve.h
uproc_ecurve_stores() :
ecurve.h
uproc_ecurve_storev() :
ecurve.h
UPROC_EEXIST :
error.h
UPROC_EINVAL :
error.h
UPROC_EIO :
error.h
UPROC_ENOENT :
error.h
UPROC_ENOMEM :
error.h
UPROC_ENOTSUP :
error.h
UPROC_EPSILON :
common.h
uproc_errloc :
error.h
uproc_errmsg :
error.h
UPROC_ERRNO :
error.h
uproc_errno :
error.h
uproc_error :
error.h
uproc_error_code :
error.h
uproc_error_handler :
error.h
uproc_error_msg :
error.h
uproc_error_set_handler() :
error.h
UPROC_FAILURE :
error.h
uproc_family :
common.h
UPROC_FAMILY_INVALID :
common.h
UPROC_FAMILY_MAX :
common.h
UPROC_FAMILY_PRI :
common.h
UPROC_FAMILY_SCN :
common.h
uproc_features_mmap() :
features.h
uproc_features_openmp() :
features.h
uproc_features_print() :
features.h
uproc_features_version() :
features.h
uproc_features_zlib() :
features.h
uproc_features_zlib_version() :
features.h
uproc_idmap_create() :
idmap.h
uproc_idmap_destroy() :
idmap.h
uproc_idmap_family() :
idmap.h
uproc_idmap_load() :
idmap.h
uproc_idmap_loads() :
idmap.h
uproc_idmap_loadv() :
idmap.h
uproc_idmap_store() :
idmap.h
uproc_idmap_stores() :
idmap.h
uproc_idmap_storev() :
idmap.h
uproc_idmap_str() :
idmap.h
uproc_io_close() :
io.h
uproc_io_eof() :
io.h
uproc_io_getline() :
io.h
uproc_io_gets() :
io.h
UPROC_IO_GZIP :
io.h
uproc_io_open() :
io.h
uproc_io_openv() :
io.h
uproc_io_printf() :
io.h
uproc_io_putc() :
io.h
uproc_io_puts() :
io.h
uproc_io_read() :
io.h
uproc_io_seek() :
io.h
UPROC_IO_SEEK_CUR :
io.h
UPROC_IO_SEEK_SET :
io.h
uproc_io_seek_whence :
io.h
UPROC_IO_STDIO :
io.h
uproc_io_stdstream() :
io.h
uproc_io_stdstream_gz() :
io.h
uproc_io_tell() :
io.h
uproc_io_type :
io.h
uproc_io_write() :
io.h
uproc_list_add() :
list.h
uproc_list_append :
list.h
uproc_list_clear() :
list.h
uproc_list_create() :
list.h
uproc_list_destroy() :
list.h
uproc_list_extend :
list.h
uproc_list_get_all :
list.h
uproc_list_map() :
list.h
uproc_list_pop :
list.h
uproc_list_set :
list.h
uproc_list_size() :
list.h
uproc_matrix_create() :
matrix.h
uproc_matrix_destroy() :
matrix.h
uproc_matrix_dimensions() :
matrix.h
uproc_matrix_get() :
matrix.h
uproc_matrix_load() :
matrix.h
uproc_matrix_loads() :
matrix.h
uproc_matrix_loadv() :
matrix.h
uproc_matrix_set() :
matrix.h
uproc_matrix_store() :
matrix.h
uproc_matrix_stores() :
matrix.h
uproc_matrix_storev() :
matrix.h
uproc_model_codon_scores() :
model.h
uproc_model_destroy() :
model.h
uproc_model_load() :
model.h
uproc_model_orf_threshold() :
model.h
uproc_model_substitution_matrix() :
model.h
uproc_nt :
codon.h
UPROC_NT_A :
codon.h
UPROC_NT_BITS :
codon.h
UPROC_NT_C :
codon.h
UPROC_NT_G :
codon.h
UPROC_NT_N :
codon.h
UPROC_NT_NOT_CHAR :
codon.h
UPROC_NT_NOT_IUPAC :
codon.h
UPROC_NT_T :
codon.h
UPROC_NT_U :
codon.h
uproc_orf_codonscores() :
orf.h
uproc_orf_copy() :
orf.h
UPROC_ORF_FRAMES :
orf.h
uproc_orf_free() :
orf.h
uproc_orf_init() :
orf.h
UPROC_ORF_INITIALIZER :
orf.h
uproc_orffilter :
orf.h
uproc_orfiter_create() :
orf.h
uproc_orfiter_destroy() :
orf.h
uproc_orfiter_next() :
orf.h
uproc_perror() :
error.h
UPROC_POW6 :
common.h
uproc_prefix :
common.h
UPROC_PREFIX_LEN :
common.h
UPROC_PREFIX_MAX :
common.h
UPROC_PREFIX_PRI :
common.h
UPROC_PREFIX_SCN :
common.h
UPROC_PROTCLASS_ALL :
protclass.h
uproc_protclass_classify() :
protclass.h
uproc_protclass_create() :
protclass.h
uproc_protclass_destroy() :
protclass.h
UPROC_PROTCLASS_MAX :
protclass.h
uproc_protclass_mode :
protclass.h
uproc_protclass_set_trace() :
protclass.h
uproc_protclass_trace_cb :
protclass.h
uproc_protfilter :
protclass.h
uproc_protresult_copy() :
protclass.h
uproc_protresult_free() :
protclass.h
uproc_protresult_init() :
protclass.h
UPROC_PROTRESULT_INITIALIZER :
protclass.h
uproc_seqiter_create() :
seqio.h
uproc_sequence_copy() :
seqio.h
uproc_sequence_free() :
seqio.h
uproc_sequence_init() :
seqio.h
UPROC_SEQUENCE_INITIALIZER :
seqio.h
uproc_stderr :
io.h
uproc_stderr_gz :
io.h
uproc_stdin :
io.h
uproc_stdout :
io.h
uproc_stdout_gz :
io.h
uproc_substmat_align_suffixes() :
substmat.h
uproc_substmat_create() :
substmat.h
uproc_substmat_destroy() :
substmat.h
uproc_substmat_get() :
substmat.h
uproc_substmat_load() :
substmat.h
uproc_substmat_loadv() :
substmat.h
uproc_substmat_set() :
substmat.h
UPROC_SUCCESS :
error.h
uproc_suffix :
common.h
UPROC_SUFFIX_LEN :
common.h
UPROC_SUFFIX_PRI :
common.h
UPROC_SUFFIX_SCN :
common.h
uproc_word_append() :
word.h
uproc_word_cmp() :
word.h
uproc_word_from_string() :
word.h
UPROC_WORD_INITIALIZER :
word.h
UPROC_WORD_LEN :
common.h
uproc_word_prepend() :
word.h
uproc_word_startswith() :
word.h
uproc_word_to_string() :
word.h
uproc_worditer :
word.h
uproc_worditer_create() :
word.h
uproc_worditer_destroy() :
word.h
uproc_worditer_next() :
word.h
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